注意使用时间，无论是微生物肥料还是菌剂，施用时间一般是清晨或多云的天气，微生物制剂中的芽孢杆菌不能直接暴露在阳光下，这会影响其繁殖、代谢等活动，甚至失活，需要避免在炎热的天气里使用。

       微生物肥料不应长期放置，应在使用时购买，使用前，应存放在阴凉、干燥、通风的地方，避免高温、潮湿和阳光直射，肥料开封后，应一次性用完，否则会导致其他细菌进入并污染肥料中的细菌。

       注意不要随意混合肥料，虽然细菌可以与化肥和有机肥混合，但这并不意味着它们可以随意混合，当肥料中氮、磷、钾等元素的总含量超过一定程度时，细菌的活性将受到很大程度的抑制，当化学肥料和细菌肥料混合时，我们建议在使用时混合它们，如果菌肥中的细菌对化肥有良好的耐受性，它们可以混合使用。

       微生物制剂不应与能杀死有益细菌的物质一起使用，由于微生物制剂中含有大量有益的活菌，严禁与杀菌剂、杀虫剂、除草剂、含硫肥料混合，因为这些杀虫剂或肥料中的物质很容易导致细菌失活，导致其效果丧失。